口腔内には多くの細菌が存在し、これを口腔常在菌というが、
この中にはミュータンス連鎖球菌を中心とする齲蝕原因菌が存在する。これらは
食品、
特に砂糖やデンプン等の糖質を酸に変える。糖質の中でも、砂糖の主成分であるス
クロースは酸産生能は高く、
キシリトール等は低い。齲蝕原因菌と酸、食物残渣、唾液は結合し、歯垢となって歯に結合する。
これは大臼歯の咬合面の溝や、全ての歯の歯肉縁、
歯科修復材料と歯の境において最も顕著である。
歯垢が歯から取り除かれないと次第に歯石となる。歯垢や歯石は歯肉縁を刺激し、歯肉炎となり、最終的には歯周炎となる。
歯垢の中の酸は
エナメル質を溶かし穴を作る。最初期の段階では、エナメル質の抵抗性と歯の再石灰化のため、
エナメル質表層は溶けず、その下から溶け始める。これをエナメル質の表層下脱灰といい、この段階を初期齲蝕という。
この段階では、まだ、再石灰化により、歯が元に戻る可能性がある